antifungal arşivleri - Redo Analyzer

mushrooms-2798150_1920-1280x853.jpg

Fungal peptitlerin, depsipeptitlerin ve peptaibiyotiklerin çeşitli sınıfları son zamanlarda kapsamlı bir şekilde gözden geçirilmiştir. Mantar ve bakteriyel NRP bileşimi, 10.000’den fazla monomer oluşumunu ve 500 farklı monomer türünü temsil eden 1000’den fazla peptidi kataloglayan Norine veri tabanının bir analizine dayalı olarak karşılaştırıldı. Bu peptitlerin çoğu normalde gıdalarda bulunmaz, ancak ara sıra salgınlar bildirilmiştir. Daha da önemlisi, biyokimyasal özellikleri onları örneğin gıda ambalajlarında haşere kontrolü için yeni araçların geliştirilmesi için umut verici adaylar haline getiriyor. En çok olanlarda yoğun olarak araştırılan özellikler, çift katmanlı lipid membranlarda gözenek oluşumu ve ayrıca antibakteriyel, antifungal, bazen antiviral, insektisidal ve antiparaziter aktivitelerdir. Bu yeni araştırma alanları, biyolojik örneklerde analitik araştırma yöntemlerinin araştırılmasını teşvik etmiştir. Son zamanlarda, ‘peptaibiom’ ve ‘peptaibiomics’ terimleri- proteom ve proteomiklere benzer şekilde- tanımlamak için önerilmiştir.

Tanımlanmış koşullar altında bir mantar suşu tarafından üretilen peptaibiyotiklerin bütünlüğünü ve dinamiklerini analiz etme yaklaşımı. Örneğin, hızlı ve seçici bir katı faz özütleme (SPE) yöntemiyle, peptaibiyotik içeren fraksiyon seçici olarak absorbe edildi ve elüat daha sonra ESI-IT-MS/MS ile birleştirilmiş HPLC ile analiz edildi. IT-MS’nin tarama için avantajı, teşhis ürününün veya yavrularının bir soyağacının oluşturulmasıdır. Örneğin, He ve Ar gibi asal gazlarla veya yüksek saflıkta N2 ile çarpışma yoluyla oluşturulan her MS2 üretimi ayrı ayrı parçalanabilir ve böylece MS3 ürün iyonları üretilebilir. Bu iyonların daha fazla parçalanması, MS4 ürün iyonları vb. ile sonuçlanacaktır. Bazı Pseudomonas türleri, protein olmayan amino asitler içeren ve lipodepsipeptidler (LDP’ler) adı verilen uzun bir lipid zincirine bağlı siklik NRP’ler üretebilir. Bir grup, uzun zincirli bir 3-hidroksi yağ asidi ile asillenmiş nonapeptit laktonlardan oluşur ve siringoamisinleri (SR’ler) içerir; siringotoksinler (ST’ler), siringostatinler ve psödomisinler. Diğer grup, uzun ve yüksek derecede hidrofobik bir peptit zinciri tarafından oluşturulan, polar laktonize penta- veya okta-peptit yarımı ile C-sonlandırılan lipopeptitleri içerir, bu grup şunları içerir: tolaasinler, siringopeptinler (SP’ler), fuscopeptinler (FP’ler) ve korpeptinler. Bu moleküller, biyolojik zarların geçirgenliğini değiştirebilir, böylece güçlü bir antibiyotik etkisi uygular. Üreten birçok suş aslında çifte anlama sahiptir: bazı bitki türleri için patojeniktirler, ancak diğerleri için patojenlere karşı koruma sağlayan biyokontrol ajanları olarak işlev görürler. MS prosedürleri, LDP üreten bakteri suşlarının taranması ve bireysel LDP’lerin tanımlanması ve değerlendirilmesi için oluşturulmuştur. Bunlar, örneğin hasat sonrası mantar hastalıklarının biyolojik kontrolü gibi potansiyel uygulamalar açısından pratik değerde olabilir.


İletişim

Mahmutbey Mahallesi, Dilmenler Caddesi, No:2, Bağcılar/İSTANBUL
+90 (506) 731 73 34

+90 (212) 599 18 19

+90 (212) 599 18 13

info@analyzer.com.tr

Bizi Takip Edin

Bizi sosyal medya platformlarından da takip edebilirsiniz.